其母有邰氏女，曰姜原。姜原為帝嚳元妃」，也就是周人也是帝嚳的后裔，那麼商周豈不是同源了嗎？然而根據西周姬姓貴族大墓的檢測，西周王族的父系基因為N-1998，和C完全不是一個系統的。

春秋戰國時期，許多中原之外的方國崛起，司馬遷也記載這些方國就是黃帝的后裔。例如，在東南地區崛起了吳越兩大國。關于吳國，司馬遷記載「吳太伯，太伯弟仲雍，皆周太王之子，而王季歷之兄也。」也就是吳國是西周王族后裔。目前，尚未有吳國公族的DNA檢測數據，因此這里不再論述。

關于越國，司馬遷記載為夏朝王族后裔的封國，「越王勾踐，其先禹之苗裔，而夏后帝少康之庶子也。」不過根據23魔方基因的檢測，認為越國公族的父系基因為O-F656，屬于O1這個系統，這說明越國王族屬于土著的百越民族，并非大禹的西羌集團。

還有許多先秦文獻記載越國王族并非娰姓，而是羋姓，也就是和楚國同源，例如《國語·鄭語》云：「羋姓夔、越」，《世本》說：「越，羋姓也，與楚同祖」，《墨子》記載：「昔者楚熊麗始封此睢山之間，越王繄虧出自有遽，始邦于越。」從分子人類學和文化上來說，楚國和越國王族同出一脈的可能性更大，而司馬遷卻將之改為了夏朝后裔。

不僅如此，司馬遷還將匈奴人和夏朝攀上的關系，「匈奴，其先祖夏后氏之苗裔也，曰淳維。」這一點的痕跡就非常明顯了，因為夏朝和匈奴完全就是不同的民族。根據對匈奴時代蒙古高原墓葬的檢測，發現匈奴貴族的父系基因主要是R和Q，其中一個單于墓被檢測為R。在所有的82個樣本中，只有一個是O系的，而且不是貴族。

匈奴墓葬父系基因統計圖

那麼，司馬遷為什麼要將所有民族的祖先都和黃帝攀上關系呢？這個還得從戰國時期說起。黃帝受到尊重，是從戰國開始的，原因是田氏齊國王族自稱是黃帝后裔，在國內扶持黃老學派。後來黃老學派在國內大規模流行，黃帝的地位就不斷提高，越來越多的貴族為了顯示正統，也就是提出自己的家族來源于黃帝。

漢朝建立初期，在全國確立主流地位的學派依然是黃老學派，包括司馬遷的父親司馬談也是尊崇黃老之人，因此他們也認為自己的祖先來自于黃帝。同時，漢武帝推行大一統的政策，對全國的文化創作產生了深遠的影響。為了給「大一統」做思想上的服務，司馬遷也就是將各大民族的祖先都記載為了黃帝。

此后，受到司馬遷的影響，后世的史學家也往往將各種民族的祖先寫為黃帝。西南地區有著名的巴國和蜀國，但是司馬遷并未記載。直到魏晉南北朝的《華陽國志》才記載巴蜀的來源，不過《華陽國志》受到《史記》「萬系一統」思想觀的影響，也將巴國世襲和黃帝攀上了關系，其中寫道「

武王既克殷，以其宗姬封于巴。」但是《山海經》卻記載「西南有巴國。太葜生咸鳥，咸鳥生乘厘，乘厘生后照，后照是始為巴人。」

關于蜀國，《華陽國志》記載「黃帝之子昌意取蜀山氏之女昌仆，生子高陽，是為帝顓頊，封其支庶于蜀，世為侯伯。」這個造假的痕跡非常明顯。

歷朝歷代的皇族在組織編史的時候，都會讓史學家將自己的家族和黃帝攀上關系，即使這個民族是剛剛入主中原不久的游牧民族也是如此，目的是為了彰顯正統。例如《魏書》記載拓跋鮮卑的來源為：「昔黃帝有子二十五人，或內列諸華，或外分荒服，昌邑少子，受封北土，國有大鮮卑山，因以為號」，這個記載已經和之前的各種文獻沖突了，其他文獻基本記載鮮卑是「東胡雜種」，是因為被匈奴擊敗而逃到鮮卑山（大興安嶺）的，這里竟然和黃帝也攀上了關系。而鮮卑的各種墓葬也證明了鮮卑的父系基因就是C，典型的東胡。

鮮卑遷徙

因此，二十四史中關于各族傳說世襲的記載，只要和黃帝搭上關系的，基本都是為了正統而宣傳的，不能信以為真。除了《史記》之外，還有《世本》《山海經》也記載了許多先秦世系，但是基本都和《史記》矛盾。從可靠性來看，《山海經》的世系更可靠，因為《山海經》保留了許多比較原始的資料。

有意思的是《山海經》記載黃帝的后裔是戎狄，如「有北狄之國，黃帝之孫曰始均，始均生北狄。」「有人名曰犬戎，黃帝生苗龍，苗龍生融吾，融吾生弄明，弄明生白犬，白犬有牝牡，是為犬戎。」歷史上第一次出現祭祀黃帝的記載是春秋末期，秦靈公「作吳陽上畤，專祭黃帝」，其地點正好就是戎狄活動的地區。